Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EP400Q96L91 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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EP400Q96L91 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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EP400Q96L91 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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EP400Q96L91 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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EP400Q96L91 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
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EP400Q96L91 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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EP400Q96L91 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EP400Q96L91 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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