Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGSF1Q8N6C5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGSF1Q8N6C5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms