Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM236Q5W0B7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms