Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF628Q5EBL2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF628Q5EBL2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms