Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C4orf17Q53FE4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C4orf17Q53FE4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms