Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GREB1Q4ZG55 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GREB1Q4ZG55 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GREB1Q4ZG55 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GREB1Q4ZG55 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GREB1Q4ZG55 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GREB1Q4ZG55 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GREB1Q4ZG55 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GREB1Q4ZG55 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GREB1Q4ZG55 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GREB1Q4ZG55 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GREB1Q4ZG55 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GREB1Q4ZG55 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GREB1Q4ZG55 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GREB1Q4ZG55 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GREB1Q4ZG55 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GREB1Q4ZG55 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GREB1Q4ZG55 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GREB1Q4ZG55 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GREB1Q4ZG55 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GREB1Q4ZG55 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GREB1Q4ZG55 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GREB1Q4ZG55 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GREB1Q4ZG55 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GREB1Q4ZG55 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GREB1Q4ZG55 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GREB1Q4ZG55 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GREB1Q4ZG55 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GREB1Q4ZG55 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GREB1Q4ZG55 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GREB1Q4ZG55 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GREB1Q4ZG55 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GREB1Q4ZG55 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GREB1Q4ZG55 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GREB1Q4ZG55 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GREB1Q4ZG55 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GREB1Q4ZG55 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GREB1Q4ZG55 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms