Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00303Q3SY05 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms