Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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RRN3P1Q2M238 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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RRN3P1Q2M238 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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RRN3P1Q2M238 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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RRN3P1Q2M238 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RRN3P1Q2M238 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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