Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KNOP1Q1ED39 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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