Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CARTPTQ16568 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms