Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PCSK7Q16549 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms