Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCN9AQ15858 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCN9AQ15858 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SCN9AQ15858 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
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