Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CDSNQ15517 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms