Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SMCO1Q147U7 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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