Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMC1AQ14683 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms