Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CKAP5Q14008 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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