Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPTAN1Q13813 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPTAN1Q13813 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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