Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOFQ13790 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOFQ13790 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOFQ13790 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOFQ13790 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOFQ13790 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOFQ13790 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOFQ13790 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOFQ13790 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOFQ13790 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOFQ13790 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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APOFQ13790 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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APOFQ13790 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOFQ13790 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOFQ13790 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOFQ13790 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOFQ13790 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOFQ13790 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOFQ13790 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOFQ13790 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOFQ13790 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOFQ13790 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOFQ13790 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOFQ13790 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOFQ13790 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOFQ13790 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOFQ13790 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOFQ13790 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOFQ13790 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOFQ13790 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOFQ13790 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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