Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ALCAMQ13740 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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