Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1SQ13698 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1SQ13698 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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