Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEUROD1Q13562 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEUROD1Q13562 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
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