Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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