Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
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MKRN4PQ13434 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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MKRN4PQ13434 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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MKRN4PQ13434 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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MKRN4PQ13434 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
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MKRN4PQ13434 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
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MKRN4PQ13434 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
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MKRN4PQ13434 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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MKRN4PQ13434 BOLL-205ENST00000433157 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
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MKRN4PQ13434 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 VN1R11P-201ENST00000407795 868 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
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