Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHAF1AQ13111 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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