Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
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