Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX1T1Q06455 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RUNX1T1Q06455 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms