Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNEQ04844 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNEQ04844 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms