Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GCNT1Q02742 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms