Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF17Q02223 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms