Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC6A3Q01959 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms