Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN10P78369 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms