Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HERVK_113P63132 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms