Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AFDNP55196 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AFDNP55196 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AFDNP55196 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AFDNP55196 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AFDNP55196 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AFDNP55196 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AFDNP55196 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AFDNP55196 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AFDNP55196 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AFDNP55196 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AFDNP55196 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AFDNP55196 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AFDNP55196 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AFDNP55196 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AFDNP55196 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AFDNP55196 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AFDNP55196 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AFDNP55196 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AFDNP55196 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AFDNP55196 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AFDNP55196 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AFDNP55196 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AFDNP55196 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AFDNP55196 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AFDNP55196 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AFDNP55196 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AFDNP55196 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
AFDNP55196 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AFDNP55196 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.33■■□□□ 1
AFDNP55196 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
AFDNP55196 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AFDNP55196 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AFDNP55196 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AFDNP55196 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AFDNP55196 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AFDNP55196 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AFDNP55196 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AFDNP55196 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AFDNP55196 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AFDNP55196 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AFDNP55196 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AFDNP55196 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AFDNP55196 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AFDNP55196 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AFDNP55196 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AFDNP55196 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AFDNP55196 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AFDNP55196 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AFDNP55196 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AFDNP55196 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AFDNP55196 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AFDNP55196 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AFDNP55196 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AFDNP55196 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AFDNP55196 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AFDNP55196 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
AFDNP55196 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
AFDNP55196 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AFDNP55196 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AFDNP55196 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AFDNP55196 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms