Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPIAP49247 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPIAP49247 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPIAP49247 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPIAP49247 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPIAP49247 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPIAP49247 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPIAP49247 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPIAP49247 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPIAP49247 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPIAP49247 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPIAP49247 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPIAP49247 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPIAP49247 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPIAP49247 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPIAP49247 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPIAP49247 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPIAP49247 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPIAP49247 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPIAP49247 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPIAP49247 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPIAP49247 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPIAP49247 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPIAP49247 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPIAP49247 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPIAP49247 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPIAP49247 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPIAP49247 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RPIAP49247 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RPIAP49247 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPIAP49247 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPIAP49247 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPIAP49247 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPIAP49247 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPIAP49247 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPIAP49247 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPIAP49247 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPIAP49247 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPIAP49247 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPIAP49247 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPIAP49247 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPIAP49247 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPIAP49247 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPIAP49247 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPIAP49247 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPIAP49247 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPIAP49247 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPIAP49247 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPIAP49247 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPIAP49247 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPIAP49247 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPIAP49247 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPIAP49247 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPIAP49247 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPIAP49247 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPIAP49247 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RPIAP49247 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPIAP49247 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPIAP49247 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RPIAP49247 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RPIAP49247 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPIAP49247 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPIAP49247 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPIAP49247 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPIAP49247 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPIAP49247 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPIAP49247 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPIAP49247 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPIAP49247 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPIAP49247 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPIAP49247 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPIAP49247 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPIAP49247 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPIAP49247 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPIAP49247 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RPIAP49247 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPIAP49247 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPIAP49247 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPIAP49247 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPIAP49247 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPIAP49247 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPIAP49247 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPIAP49247 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPIAP49247 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPIAP49247 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPIAP49247 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPIAP49247 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPIAP49247 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPIAP49247 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPIAP49247 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPIAP49247 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RPIAP49247 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RPIAP49247 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RPIAP49247 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPIAP49247 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPIAP49247 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPIAP49247 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPIAP49247 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPIAP49247 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPIAP49247 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms