Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFTPDP35247 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTPDP35247 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms