Protein–RNA interactions for Protein: P31150

GDI1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI1P31150 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDI1P31150 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDI1P31150 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDI1P31150 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDI1P31150 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDI1P31150 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDI1P31150 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDI1P31150 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDI1P31150 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDI1P31150 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDI1P31150 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDI1P31150 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDI1P31150 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDI1P31150 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDI1P31150 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDI1P31150 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDI1P31150 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDI1P31150 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDI1P31150 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDI1P31150 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDI1P31150 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDI1P31150 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDI1P31150 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDI1P31150 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDI1P31150 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDI1P31150 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GDI1P31150 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GDI1P31150 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDI1P31150 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDI1P31150 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDI1P31150 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDI1P31150 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDI1P31150 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDI1P31150 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDI1P31150 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDI1P31150 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDI1P31150 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDI1P31150 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDI1P31150 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDI1P31150 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDI1P31150 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDI1P31150 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDI1P31150 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDI1P31150 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDI1P31150 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDI1P31150 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDI1P31150 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDI1P31150 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDI1P31150 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDI1P31150 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDI1P31150 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDI1P31150 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GDI1P31150 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms