Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms