Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO2P25791 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO2P25791 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO2P25791 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO2P25791 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO2P25791 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO2P25791 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO2P25791 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO2P25791 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO2P25791 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO2P25791 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO2P25791 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO2P25791 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO2P25791 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO2P25791 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO2P25791 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO2P25791 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO2P25791 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO2P25791 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO2P25791 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO2P25791 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO2P25791 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO2P25791 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO2P25791 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO2P25791 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO2P25791 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO2P25791 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO2P25791 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LMO2P25791 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO2P25791 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO2P25791 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO2P25791 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO2P25791 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO2P25791 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO2P25791 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO2P25791 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO2P25791 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO2P25791 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO2P25791 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO2P25791 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO2P25791 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO2P25791 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO2P25791 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO2P25791 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO2P25791 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO2P25791 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO2P25791 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO2P25791 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO2P25791 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO2P25791 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO2P25791 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO2P25791 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO2P25791 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO2P25791 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO2P25791 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO2P25791 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO2P25791 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LMO2P25791 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO2P25791 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO2P25791 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO2P25791 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO2P25791 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMO2P25791 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms