Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
POLR2AP24928 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
POLR2AP24928 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms