Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXB9P17482 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB9P17482 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms