Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPGDP15428 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPGDP15428 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPGDP15428 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPGDP15428 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPGDP15428 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPGDP15428 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPGDP15428 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPGDP15428 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPGDP15428 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HPGDP15428 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPGDP15428 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPGDP15428 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPGDP15428 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPGDP15428 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPGDP15428 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HPGDP15428 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPGDP15428 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPGDP15428 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HPGDP15428 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HPGDP15428 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPGDP15428 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPGDP15428 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPGDP15428 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPGDP15428 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPGDP15428 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPGDP15428 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPGDP15428 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPGDP15428 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPGDP15428 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPGDP15428 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPGDP15428 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPGDP15428 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPGDP15428 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPGDP15428 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPGDP15428 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPGDP15428 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPGDP15428 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPGDP15428 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPGDP15428 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPGDP15428 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPGDP15428 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HPGDP15428 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HPGDP15428 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HPGDP15428 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HPGDP15428 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms