Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL3P10147 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL3P10147 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3P10147 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3P10147 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3P10147 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3P10147 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3P10147 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3P10147 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3P10147 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3P10147 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3P10147 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3P10147 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3P10147 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3P10147 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3P10147 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3P10147 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3P10147 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3P10147 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3P10147 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3P10147 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3P10147 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL3P10147 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL3P10147 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL3P10147 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL3P10147 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL3P10147 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL3P10147 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL3P10147 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL3P10147 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL3P10147 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL3P10147 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL3P10147 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL3P10147 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL3P10147 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL3P10147 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3P10147 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3P10147 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3P10147 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3P10147 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3P10147 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3P10147 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3P10147 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3P10147 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3P10147 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3P10147 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms