Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM228BP0C875 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms