Protein–RNA interactions for Protein: P04216

THY1, Thy-1 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THY1P04216 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
THY1P04216 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
THY1P04216 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
THY1P04216 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
THY1P04216 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
THY1P04216 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
THY1P04216 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
THY1P04216 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
THY1P04216 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
THY1P04216 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
THY1P04216 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
THY1P04216 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
THY1P04216 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
THY1P04216 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
THY1P04216 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
THY1P04216 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
THY1P04216 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
THY1P04216 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
THY1P04216 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
THY1P04216 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
THY1P04216 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
THY1P04216 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
THY1P04216 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
THY1P04216 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
THY1P04216 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
THY1P04216 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
THY1P04216 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
THY1P04216 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
THY1P04216 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
THY1P04216 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
THY1P04216 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THY1P04216 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THY1P04216 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THY1P04216 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THY1P04216 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THY1P04216 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THY1P04216 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THY1P04216 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THY1P04216 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THY1P04216 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THY1P04216 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THY1P04216 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THY1P04216 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THY1P04216 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THY1P04216 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THY1P04216 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THY1P04216 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THY1P04216 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THY1P04216 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THY1P04216 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THY1P04216 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THY1P04216 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THY1P04216 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
THY1P04216 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THY1P04216 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THY1P04216 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THY1P04216 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THY1P04216 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THY1P04216 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THY1P04216 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THY1P04216 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THY1P04216 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms