Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C6orf47O95873 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms