Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POP4O95707 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POP4O95707 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POP4O95707 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POP4O95707 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POP4O95707 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POP4O95707 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POP4O95707 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POP4O95707 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POP4O95707 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POP4O95707 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POP4O95707 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POP4O95707 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POP4O95707 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POP4O95707 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POP4O95707 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POP4O95707 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POP4O95707 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
POP4O95707 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POP4O95707 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POP4O95707 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POP4O95707 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POP4O95707 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POP4O95707 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POP4O95707 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POP4O95707 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POP4O95707 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POP4O95707 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POP4O95707 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POP4O95707 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POP4O95707 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POP4O95707 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POP4O95707 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POP4O95707 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POP4O95707 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POP4O95707 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POP4O95707 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POP4O95707 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POP4O95707 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POP4O95707 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POP4O95707 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POP4O95707 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POP4O95707 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POP4O95707 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POP4O95707 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POP4O95707 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POP4O95707 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POP4O95707 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POP4O95707 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POP4O95707 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POP4O95707 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POP4O95707 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POP4O95707 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POP4O95707 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POP4O95707 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms