Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TO15178 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TO15178 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TO15178 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TO15178 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TO15178 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TO15178 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TO15178 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TO15178 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TO15178 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TO15178 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TO15178 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TO15178 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TO15178 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TO15178 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TO15178 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TO15178 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TO15178 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TO15178 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TO15178 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TO15178 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TO15178 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TO15178 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TO15178 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TO15178 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TO15178 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TO15178 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TO15178 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TO15178 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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