Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SETD1AO15047 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD1AO15047 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms