Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RGPD3A6NKT7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGPD3A6NKT7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms