Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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ARL2-SNX15V9GYD0 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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ARL2-SNX15V9GYD0 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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ARL2-SNX15V9GYD0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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ARL2-SNX15V9GYD0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ARL2-SNX15V9GYD0 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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